 Andrej Studen
|
425922f219
Adding comments to runSegmentationnnUNet.py
|
před 3 roky |
|
Andrej Studen
|
f1c4e7b732
Adding un-buffer flag to python for uptodate output
|
před 3 roky |
|
Andrej Studen
|
083ed06079
Changing to nixWrapper
|
před 3 roky |
|
Andrej Studen
|
ab22d0e9bf
Splitting runPython.sh to runPythonnnUNet.sh to use with nnUNet code
|
před 3 roky |
 Andrej Studen
|
9ae439d111
Adding segmentation configuration files
|
před 3 roky |
|
Andrej Studen
|
4d0276ab7b
Have runPython.sh run within venv, nnUnet set
|
před 3 roky |
 Andrej
|
cdb79e7b12
Removing saved_models from irAEMM project (moving it to irAEMMSegmentationModels project)
|
před 3 roky |
|
Andrej
|
43c785d716
Adding test.py script
|
před 3 roky |
|
Andrej
|
90b4734ea6
Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation
|
před 3 roky |
|
Andrej
|
14346cae34
minor changes to default parameter values in segmentation.json.sample
|
před 3 roky |
|
Andrej
|
7610919def
Moving saved_models to irAEMMSegmentationModels project
|
před 3 roky |
|
Andrej
|
1bdf95612e
Adding automated segmentation script
|
před 3 roky |
|
Andrej
|
8a8b58d515
Adding default view as segmentationReview
|
před 3 roky |
 Andrej Studen/Merlin
|
cc26fefd7c
Making run segmentation for non-divided files
|
před 3 roky |
 NIX User
|
e18a635685
Merge branch 'master' of wiscigt.powertheword.com:oil/iraemm
|
před 3 roky |
|
NIX User
|
05fa966798
Recent updates
|
před 3 roky |
|
Andrej Studen/Merlin
|
b52ae890d7
Merge branch 'master' of wiscigt.powertheword.com:oil/iraemm
|
před 3 roky |
|
Andrej Studen/Merlin
|
d449f0095c
Recent updates
|
před 3 roky |
|
Andrej
|
4daeb8a35d
Changing slicerModule directory to default
|
před 4 roky |
|
Andrej
|
f6b61e81c1
Updated version that is based of labkeyInterface
|
před 4 roky |
|
Andrej
|
09158d192d
Merge branch 'master' of wiscigt.powertheword.com:oil/iraemm
|
před 4 roky |
|
Andrej
|
82177d2c7a
Updating iraemmBrowser to allow multiuser segmentation and adverse effect detection review
|
před 4 roky |
|
Andrej Studen/Merlin
|
d23fdfb3fd
Updating preprocess.py
|
před 4 roky |
|
Andrej Studen/Merlin
|
3dec2cb5da
Update add segmentations
|
před 4 roky |
|
Andrej Studen/Merlin
|
f4eaa26542
Adding updates to segmentation
|
před 4 roky |
|
NIX User
|
b64adcfd2b
Updates to runSegmentation and associated configuration
|
před 4 roky |
|
NIX User
|
dec7d0b62c
Merge branch 'master' of wiscigt.powertheword.com:oil/iraemm
|
před 4 roky |
|
NIX User
|
6551f17992
Have preprocess.py look in setup file to figure local postions of matlab, etc.
|
před 4 roky |
|
NIX User
|
07478c6846
Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure
|
před 4 roky |
|
Andrej
|
b0705b354d
Adding patientmask to outputs of preprocess.py
|
před 4 roky |
