 Andrej Studen
|
957b0c2fff
Updates to automatic routines
|
преди 3 години |
 Andrej Studen
|
e452adcbb8
Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json
|
преди 3 години |
|
Andrej Studen
|
d18ee3ff86
Correcting spelling error
|
преди 3 години |
|
Andrej Studen
|
c7f8174426
Adding organ_percentile calculation, runs with segmentation.json
|
преди 3 години |
|
Andrej Studen
|
60021e7a8e
Adding script use in nnUNet on IRAEMM images
|
преди 3 години |
|
Andrej Studen
|
fc25bd8249
Merge branch 'master' of wiscigt.powertheword.com:oil/iraemm
|
преди 3 години |
|
Andrej Studen
|
0cb3f65861
Adding comments and redirecting gzip to setup.json indicated binary in preprocess.py
|
преди 3 години |
|
Andrej Studen
|
425922f219
Adding comments to runSegmentationnnUNet.py
|
преди 3 години |
 NIX User
|
1cb816f9f9
Merge to core
|
преди 3 години |
|
NIX User
|
daba75cfbe
Adding preprocessing template
|
преди 3 години |
|
NIX User
|
e480f09ed5
Adding -u and flag to runPython
|
преди 3 години |
|
NIX User
|
7df6a921f2
Updating populateImageFromTransferList to update failureStatus
|
преди 3 години |
|
NIX User
|
d027e88d51
Adding findCandidatesForSchedule.py
|
преди 3 години |
|
Andrej Studen
|
f1c4e7b732
Adding un-buffer flag to python for uptodate output
|
преди 3 години |
|
Andrej Studen
|
083ed06079
Changing to nixWrapper
|
преди 3 години |
|
Andrej Studen
|
ab22d0e9bf
Splitting runPython.sh to runPythonnnUNet.sh to use with nnUNet code
|
преди 3 години |
|
Andrej Studen
|
9ae439d111
Adding segmentation configuration files
|
преди 3 години |
|
Andrej Studen
|
4d0276ab7b
Have runPython.sh run within venv, nnUnet set
|
преди 3 години |
 Andrej
|
cdb79e7b12
Removing saved_models from irAEMM project (moving it to irAEMMSegmentationModels project)
|
преди 3 години |
|
Andrej
|
43c785d716
Adding test.py script
|
преди 3 години |
|
Andrej
|
90b4734ea6
Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation
|
преди 3 години |
|
Andrej
|
14346cae34
minor changes to default parameter values in segmentation.json.sample
|
преди 3 години |
|
Andrej
|
7610919def
Moving saved_models to irAEMMSegmentationModels project
|
преди 3 години |
|
Andrej
|
1bdf95612e
Adding automated segmentation script
|
преди 3 години |
|
Andrej
|
8a8b58d515
Adding default view as segmentationReview
|
преди 3 години |
 Andrej Studen/Merlin
|
cc26fefd7c
Making run segmentation for non-divided files
|
преди 4 години |
|
NIX User
|
e18a635685
Merge branch 'master' of wiscigt.powertheword.com:oil/iraemm
|
преди 4 години |
|
NIX User
|
05fa966798
Recent updates
|
преди 4 години |
|
Andrej Studen/Merlin
|
b52ae890d7
Merge branch 'master' of wiscigt.powertheword.com:oil/iraemm
|
преди 4 години |
|
Andrej Studen/Merlin
|
d449f0095c
Recent updates
|
преди 4 години |
