Andrej Studen @ VBOX 984655eb1a Adding python routines for NPZ coding and decoding 1 рік тому
..
README.md 0ea84c60d5 Changing README to md format, allowing pre-configured path for model in testConfig 1 рік тому
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations 4 роки тому
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates 4 роки тому
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version 4 роки тому
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates 3 роки тому
copyAnonymizedDataset.py 5c691d080a Adding copyAnonymizedDataset.py 2 роки тому
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 роки тому
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import 4 роки тому
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 роки тому
findCandidatesForSchedule.py d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py 3 роки тому
generateFigures.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. 3 роки тому
generateNPZ.ipynb 7d32a10f56 AIQ verified version of NPZ generation 1 рік тому
generateNPZ.py 984655eb1a Adding python routines for NPZ coding and decoding 1 рік тому
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import 4 роки тому
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 роки тому
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import 4 роки тому
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 роки тому
modifyDataset.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json 3 роки тому
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 роки тому
organ_percentile.py f50a92ad9c Expanding analysis to additional segmentations in organ_percentile 2 роки тому
parseNPZ.py 984655eb1a Adding python routines for NPZ coding and decoding 1 рік тому
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure 4 роки тому
populateImagingFromTransferList.py f045cc682d Correcting a dangling if clause in populateImagingFromTransferList.py 2 роки тому
preprocess.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. 3 роки тому
runPython.sh 1cb816f9f9 Merge to core 3 роки тому
runPythonnnUNet.sh f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output 3 роки тому
runSegmentationDM.py 6ddf9fcc67 Adding entry filter to allow for selection in processing, also, debug parameter in template stops processing after the first entry 1 рік тому
runSegmentationnnUNet.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. 3 роки тому
test.py 43c785d716 Adding test.py script 3 роки тому

README.md

Run with ./runPython.sh script.py