Начало Каталог Помощ
Вход
studen
/
irAEMM
1
0
Разклонения 0
Файлове Задачи 0 Заявки за сливане 0 Уики
ИН на ревизия: bbed7b3e28
Клонове Маркери
irAEMM
/
pythonScripts
Andrej Studen bbed7b3e28 Merge branch 'master' of https://git0.fmf.uni-lj.si/studen/irAEMM преди 3 години
..
README 53fb46eaa9 Updating to recent version преди 4 години
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations преди 4 години
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates преди 4 години
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version преди 4 години
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates преди 3 години
copyAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines преди 4 години
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines преди 4 години
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import преди 4 години
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation преди 3 години
findCandidatesForSchedule.py d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py преди 3 години
generateFigures.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. преди 3 години
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import преди 4 години
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation преди 3 години
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import преди 4 години
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines преди 4 години
modifyDataset.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json преди 3 години
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines преди 4 години
organ_percentile.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. преди 3 години
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure преди 4 години
populateImagingFromTransferList.py d4e0acb3ef Allow populateImaging to detect not only missing images, but multiple matches as well. Signaled by empty CT/PET_orthancId and lines in missingImages преди 3 години
preprocess.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. преди 3 години
runPython.sh 1cb816f9f9 Merge to core преди 3 години
runPythonnnUNet.sh f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output преди 3 години
runSegmentationDM.py 9ae439d111 Adding segmentation configuration files преди 3 години
runSegmentationnnUNet.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. преди 3 години
test.py 43c785d716 Adding test.py script преди 3 години

README

Run with ./runPython.sh script.py