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Struktur: de0c3210bc
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pythonScripts
NIX User de0c3210bc Merge branch 'master' of https://git0.fmf.uni-lj.si/studen/iraemm vor 2 Jahren
..
README 53fb46eaa9 Updating to recent version vor 4 Jahren
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations vor 4 Jahren
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates vor 4 Jahren
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version vor 4 Jahren
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates vor 3 Jahren
copyAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines vor 4 Jahren
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines vor 4 Jahren
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import vor 4 Jahren
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation vor 3 Jahren
findCandidatesForSchedule.py d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py vor 3 Jahren
generateFigures.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. vor 3 Jahren
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import vor 4 Jahren
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation vor 3 Jahren
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import vor 4 Jahren
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines vor 4 Jahren
modifyDataset.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json vor 3 Jahren
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines vor 4 Jahren
organ_percentile.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. vor 3 Jahren
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure vor 4 Jahren
populateImagingFromTransferList.py de0e000713 Correcting populateImagingFromTransferList to post studyDate to labkey vor 2 Jahren
preprocess.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. vor 3 Jahren
runPython.sh 1cb816f9f9 Merge to core vor 3 Jahren
runPythonnnUNet.sh f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output vor 3 Jahren
runSegmentationDM.py 9ae439d111 Adding segmentation configuration files vor 3 Jahren
runSegmentationnnUNet.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. vor 3 Jahren
test.py 43c785d716 Adding test.py script vor 3 Jahren

README

Run with ./runPython.sh script.py