Почетна Преглед Помоћ
Пријавите се
studen
/
irAEMM
1
0
Креирај огранак 0
Датотеке Дискусије 0 Захтеви за спајање 0 Вики
Дрво: e50b84a2f2
Гране Ознаке
irAEMM
/
pythonScripts
Andrej Studen/Merlin fd919a26ca Merge branch 'master' of ssh://git0.fmf.uni-lj.si:2222/studen/iraemm пре 3 година
..
README 53fb46eaa9 Updating to recent version пре 4 година
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations пре 4 година
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates пре 4 година
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version пре 4 година
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates пре 3 година
copyAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines пре 4 година
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines пре 4 година
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import пре 4 година
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation пре 3 година
findCandidatesForSchedule.py d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py пре 3 година
generateFigures.py 957b0c2fff Updates to automatic routines пре 3 година
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import пре 4 година
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation пре 3 година
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import пре 4 година
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines пре 4 година
modifyDataset.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json пре 3 година
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines пре 4 година
organ_percentile.py 957b0c2fff Updates to automatic routines пре 3 година
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure пре 4 година
populateImagingFromTransferList.py 45062e572d Adding verbosity in populateImagingFromTransferList пре 3 година
preprocess.py 0cb3f65861 Adding comments and redirecting gzip to setup.json indicated binary in preprocess.py пре 3 година
runPython.sh 1cb816f9f9 Merge to core пре 3 година
runPythonnnUNet.sh f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output пре 3 година
runSegmentationDM.py 9ae439d111 Adding segmentation configuration files пре 3 година
runSegmentationnnUNet.py d18ee3ff86 Correcting spelling error пре 3 година
test.py 43c785d716 Adding test.py script пре 3 година

README

Run with ./runPython.sh script.py