Andrej Studen/Merlin fd919a26ca Merge branch 'master' of ssh://git0.fmf.uni-lj.si:2222/studen/iraemm 3 yıl önce
..
README 53fb46eaa9 Updating to recent version 4 yıl önce
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations 4 yıl önce
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates 4 yıl önce
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version 4 yıl önce
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates 3 yıl önce
copyAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 yıl önce
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 yıl önce
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import 4 yıl önce
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 yıl önce
findCandidatesForSchedule.py d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py 3 yıl önce
generateFigures.py 957b0c2fff Updates to automatic routines 3 yıl önce
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import 4 yıl önce
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 yıl önce
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import 4 yıl önce
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 yıl önce
modifyDataset.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json 3 yıl önce
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 yıl önce
organ_percentile.py 957b0c2fff Updates to automatic routines 3 yıl önce
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure 4 yıl önce
populateImagingFromTransferList.py 45062e572d Adding verbosity in populateImagingFromTransferList 3 yıl önce
preprocess.py 0cb3f65861 Adding comments and redirecting gzip to setup.json indicated binary in preprocess.py 3 yıl önce
runPython.sh 1cb816f9f9 Merge to core 3 yıl önce
runPythonnnUNet.sh f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output 3 yıl önce
runSegmentationDM.py 9ae439d111 Adding segmentation configuration files 3 yıl önce
runSegmentationnnUNet.py d18ee3ff86 Correcting spelling error 3 yıl önce
test.py 43c785d716 Adding test.py script 3 yıl önce

README

Run with ./runPython.sh script.py