Domů Procházet Nápověda
Přihlásit se
studen
/
dynamicSPECT
1
0
Rozštěpit 0
Soubory Úkoly 0 Pull Requesty 0 Wiki
Strom: 881d83b4c7
Větve Značky
dynamicSPECT
/
pythonScripts
NIX Worker 8d56a9f074 Rearranging scripts to do IO and parse config před 1 rokem
..
README.md bbe9982a4c Adding test.py slicer script před 1 rokem
analysis.py e3c0099dab Making analysis run matlab scripts directly před 1 rokem
analyze.ipynb 9941f28c57 Adding convertToNRRD.py script před 2 roky
calculateK1.ipynb 1440d682a0 Adding scripts před 3 roky
clusterAnalysis.ipynb 034e09bc30 Modified notebooks před 2 roky
clusterAnalysisLeftovers.ipynb c317e06d8d Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022. před 2 roky
config.py 8d56a9f074 Rearranging scripts to do IO and parse config před 1 rokem
downloadPatient.py 1440d682a0 Adding scripts před 3 roky
generateCenters.ipynb fde4aa8d47 Up to generate centers, including matlab files před 2 roky
getData.py 8d56a9f074 Rearranging scripts to do IO and parse config před 1 rokem
parseDicom.py 9941f28c57 Adding convertToNRRD.py script před 2 roky
pixelAnalysis.ipynb c317e06d8d Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022. před 2 roky
plotK1.ipynb 9941f28c57 Adding convertToNRRD.py script před 2 roky
plotPolar.ipynb c317e06d8d Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022. před 2 roky
plotViews.ipynb 1440d682a0 Adding scripts před 3 roky
segmentation.ipynb 034e09bc30 Modified notebooks před 2 roky
segmentation.py 8f169c6170 Moving segmentation functions from notebook to package před 2 roky
selectCenters.ipynb 1440d682a0 Adding scripts před 3 roky
statAnalysis.ipynb 1440d682a0 Adding scripts před 3 roky
table.ipynb 1440d682a0 Adding scripts před 3 roky
vtkInterface.py 9941f28c57 Adding convertToNRRD.py script před 2 roky

README.md

Instructions

Look at `clusterAnalysis.ipynb' for a step by step algorithm.

The only required files for analysis are:

  • ../slicerScripts/convertToNRRD.py
  • analysis.py
  • segmentation.py
  • getData.py
  • config.py
  • segmentation.ipynb
  • clusterAnalysis.ipynb

The rest are for backup only.