Начало Каталог Помощ
Вход
studen
/
dynamicSPECT
1
0
Разклонения 0
Файлове Задачи 0 Заявки за сливане 0 Уики
ИН на ревизия: 8d56a9f074
Клонове Маркери
dynamicSPECT
/
pythonScripts
NIX Worker 8d56a9f074 Rearranging scripts to do IO and parse config преди 2 години
..
README.md bbe9982a4c Adding test.py slicer script преди 2 години
analysis.py e3c0099dab Making analysis run matlab scripts directly преди 2 години
analyze.ipynb 9941f28c57 Adding convertToNRRD.py script преди 3 години
calculateK1.ipynb 1440d682a0 Adding scripts преди 4 години
clusterAnalysis.ipynb 034e09bc30 Modified notebooks преди 3 години
clusterAnalysisLeftovers.ipynb c317e06d8d Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022. преди 3 години
config.py 8d56a9f074 Rearranging scripts to do IO and parse config преди 2 години
downloadPatient.py 1440d682a0 Adding scripts преди 4 години
generateCenters.ipynb fde4aa8d47 Up to generate centers, including matlab files преди 3 години
getData.py 8d56a9f074 Rearranging scripts to do IO and parse config преди 2 години
parseDicom.py 9941f28c57 Adding convertToNRRD.py script преди 3 години
pixelAnalysis.ipynb c317e06d8d Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022. преди 3 години
plotK1.ipynb 9941f28c57 Adding convertToNRRD.py script преди 3 години
plotPolar.ipynb c317e06d8d Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022. преди 3 години
plotViews.ipynb 1440d682a0 Adding scripts преди 4 години
segmentation.ipynb 034e09bc30 Modified notebooks преди 3 години
segmentation.py 8f169c6170 Moving segmentation functions from notebook to package преди 3 години
selectCenters.ipynb 1440d682a0 Adding scripts преди 4 години
statAnalysis.ipynb 1440d682a0 Adding scripts преди 4 години
table.ipynb 1440d682a0 Adding scripts преди 4 години
vtkInterface.py 9941f28c57 Adding convertToNRRD.py script преди 3 години

README.md

Instructions

Look at `clusterAnalysis.ipynb' for a step by step algorithm.

The only required files for analysis are:

  • ../slicerScripts/convertToNRRD.py
  • analysis.py
  • segmentation.py
  • getData.py
  • config.py
  • segmentation.ipynb
  • clusterAnalysis.ipynb

The rest are for backup only.