Почетна Преглед Помоћ
Пријавите се
studen
/
dynamicSPECT
1
0
Креирај огранак 0
Датотеке Дискусије 0 Захтеви за спајање 0 Вики
Дрво: e3c0099dab
Гране Ознаке
dynamicSPECT
/
pythonScripts
NIX Worker e3c0099dab Making analysis run matlab scripts directly пре 1 година
..
README.md bbe9982a4c Adding test.py slicer script пре 1 година
analysis.py e3c0099dab Making analysis run matlab scripts directly пре 1 година
analyze.ipynb 9941f28c57 Adding convertToNRRD.py script пре 2 година
calculateK1.ipynb 1440d682a0 Adding scripts пре 3 година
clusterAnalysis.ipynb 034e09bc30 Modified notebooks пре 2 година
clusterAnalysisLeftovers.ipynb c317e06d8d Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022. пре 2 година
config.py c317e06d8d Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022. пре 2 година
downloadPatient.py 1440d682a0 Adding scripts пре 3 година
generateCenters.ipynb fde4aa8d47 Up to generate centers, including matlab files пре 2 година
getData.py c317e06d8d Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022. пре 2 година
parseDicom.py 9941f28c57 Adding convertToNRRD.py script пре 2 година
pixelAnalysis.ipynb c317e06d8d Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022. пре 2 година
plotK1.ipynb 9941f28c57 Adding convertToNRRD.py script пре 2 година
plotPolar.ipynb c317e06d8d Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022. пре 2 година
plotViews.ipynb 1440d682a0 Adding scripts пре 3 година
segmentation.ipynb 034e09bc30 Modified notebooks пре 2 година
segmentation.py 8f169c6170 Moving segmentation functions from notebook to package пре 2 година
selectCenters.ipynb 1440d682a0 Adding scripts пре 3 година
statAnalysis.ipynb 1440d682a0 Adding scripts пре 3 година
table.ipynb 1440d682a0 Adding scripts пре 3 година
vtkInterface.py 9941f28c57 Adding convertToNRRD.py script пре 2 година

README.md

Instructions

Look at `clusterAnalysis.ipynb' for a step by step algorithm.

The only required files for analysis are:

  • ../slicerScripts/convertToNRRD.py
  • analysis.py
  • segmentation.py
  • getData.py
  • config.py
  • segmentation.ipynb
  • clusterAnalysis.ipynb

The rest are for backup only.