| .. |
|
LambdaOptimization.png
|
5cb119b5ff
Optimization hyperparameter lambda setting illustration for regularizing on IVF parameter A
|
1 년 전 |
|
README.md
|
bbe9982a4c
Adding test.py slicer script
|
1 년 전 |
|
analysis.py
|
8d8c79e32b
Updating analysis.py to work with modified version of segmentation.py
|
1 년 전 |
|
analyze.ipynb
|
345e0bdcec
Minor updates to scripts, config file is also used in vangogh mode
|
1 년 전 |
|
assignOrthancStudy.ipynb
|
ad99d7cd50
Recent updates
|
1 년 전 |
|
calculateCenters.py
|
e556aa5b32
Adding update status function to report progress
|
1 년 전 |
|
calculateK1.ipynb
|
1440d682a0
Adding scripts
|
3 년 전 |
|
clusterAnalysis.ipynb
|
87d8bfd583
validating summaryIVF
|
1 년 전 |
|
clusterAnalysisLeftovers.ipynb
|
c317e06d8d
Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022.
|
2 년 전 |
|
config.py
|
012848dc66
Adding regularization to compartment fits
|
1 년 전 |
|
doAnalysis.py
|
a4028e9849
Minor corrections to doAnalysis
|
1 년 전 |
|
doPixelAnalysis.py
|
985248eb9f
Changing loops in doPixelAnalysis
|
1 년 전 |
|
doSummary.py
|
6f536a609c
operable doSummary.py
|
1 년 전 |
|
downloadPatient.py
|
1440d682a0
Adding scripts
|
3 년 전 |
|
fitData.py
|
012848dc66
Adding regularization to compartment fits
|
1 년 전 |
|
fitModel.py
|
012848dc66
Adding regularization to compartment fits
|
1 년 전 |
|
generateCenters.ipynb
|
fde4aa8d47
Up to generate centers, including matlab files
|
2 년 전 |
|
geometry.py
|
504c2ae9db
Adding port from matlab fitting to python fitting, new python code based on global optimization with lambda adjusted regularizer
|
1 년 전 |
|
getData.py
|
5bffcfe431
Cleared error from getData updateStatus, making sure that status is also checked for entries with converted images
|
1 년 전 |
|
loadData.py
|
012848dc66
Adding regularization to compartment fits
|
1 년 전 |
|
parseDicom.py
|
9941f28c57
Adding convertToNRRD.py script
|
2 년 전 |
|
pixelAnalysis.ipynb
|
c317e06d8d
Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022.
|
2 년 전 |
|
plotData.py
|
a0af1ed42c
Moving plotSegmentation from segmentation.py to plotData to avoid matplotlib dependency in Slicer, through convertToNRRD.py which depends on segmentation.py
|
1 년 전 |
|
plotK1.ipynb
|
9941f28c57
Adding convertToNRRD.py script
|
2 년 전 |
|
plotPolar.ipynb
|
c317e06d8d
Version that produced results sent in email to Luka, Oct 28th 2022.
|
2 년 전 |
|
plotViews.ipynb
|
1440d682a0
Adding scripts
|
3 년 전 |
|
segmentation.ipynb
|
15edb29494
Update to jupyter
|
1 년 전 |
|
segmentation.py
|
a0af1ed42c
Moving plotSegmentation from segmentation.py to plotData to avoid matplotlib dependency in Slicer, through convertToNRRD.py which depends on segmentation.py
|
1 년 전 |
|
selectCenters.ipynb
|
1440d682a0
Adding scripts
|
3 년 전 |
|
statAnalysis.ipynb
|
1440d682a0
Adding scripts
|
3 년 전 |
|
table.ipynb
|
1440d682a0
Adding scripts
|
3 년 전 |
|
test.ipynb
|
8b606a3b56
Cleaning up listCreatedFiles in workflow
|
1 년 전 |
|
vtkInterface.py
|
9941f28c57
Adding convertToNRRD.py script
|
2 년 전 |
|
workflow.py
|
7f7c5fe190
Clearing merge conflicts
|
1 년 전 |
Andrej Studen@Labkey-KNM
7f7c5fe190
Clearing merge conflicts
