Etusivu Tutki Apua
Kirjaudu sisään
studen
/
irAEMM
1
0
Fork 0
Tiedostot Ongelmat 0 Pull-pyynnöt 0 Wiki
Puu: 4d0276ab7b
Branchit Tagit
irAEMM
/
pythonScripts
Andrej Studen 4d0276ab7b Have runPython.sh run within venv, nnUnet set 3 vuotta sitten
..
README 53fb46eaa9 Updating to recent version 4 vuotta sitten
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations 4 vuotta sitten
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates 4 vuotta sitten
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version 4 vuotta sitten
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates 3 vuotta sitten
copyAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 vuotta sitten
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 vuotta sitten
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import 4 vuotta sitten
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 vuotta sitten
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import 4 vuotta sitten
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 vuotta sitten
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import 4 vuotta sitten
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 vuotta sitten
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 vuotta sitten
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure 4 vuotta sitten
populateImagingFromTransferList.py 05fa966798 Recent updates 3 vuotta sitten
preprocess.py d23fdfb3fd Updating preprocess.py 4 vuotta sitten
runPython.sh 4d0276ab7b Have runPython.sh run within venv, nnUnet set 3 vuotta sitten
runSegmentation.py 1bdf95612e Adding automated segmentation script 3 vuotta sitten
test.py 43c785d716 Adding test.py script 3 vuotta sitten

README

Run with ./runPython.sh script.py