Startsida Utforska Hjälp
Logga in
studen
/
irAEMM
1
0
Fork 0
Filer Ärenden 0 Pull-förfrågningar 0 Wiki
Träd: 4d0276ab7b
Grenar Taggar
irAEMM
/
pythonScripts
Andrej Studen 4d0276ab7b Have runPython.sh run within venv, nnUnet set 3 år sedan
..
README 53fb46eaa9 Updating to recent version 4 år sedan
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations 4 år sedan
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates 4 år sedan
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version 4 år sedan
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates 3 år sedan
copyAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 år sedan
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 år sedan
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import 4 år sedan
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 år sedan
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import 4 år sedan
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 år sedan
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import 4 år sedan
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 år sedan
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 år sedan
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure 4 år sedan
populateImagingFromTransferList.py 05fa966798 Recent updates 3 år sedan
preprocess.py d23fdfb3fd Updating preprocess.py 4 år sedan
runPython.sh 4d0276ab7b Have runPython.sh run within venv, nnUnet set 3 år sedan
runSegmentation.py 1bdf95612e Adding automated segmentation script 3 år sedan
test.py 43c785d716 Adding test.py script 3 år sedan

README

Run with ./runPython.sh script.py