Начало Каталог Помощ
Вход
studen
/
irAEMM
1
0
Разклонения 0
Файлове Задачи 0 Заявки за сливане 0 Уики
ИН на ревизия: c87c6e3cc1
Клонове Маркери
irAEMM
/
pythonScripts
Andrej Studen c87c6e3cc1 Realinging runSegmentationDM to use nixWrapper to load dependencies преди 1 година
..
README 53fb46eaa9 Updating to recent version преди 5 години
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations преди 4 години
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates преди 4 години
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version преди 5 години
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates преди 4 години
copyAnonymizedDataset.py 5c691d080a Adding copyAnonymizedDataset.py преди 2 години
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines преди 4 години
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import преди 5 години
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation преди 3 години
findCandidatesForSchedule.py d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py преди 3 години
generateFigures.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. преди 3 години
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import преди 5 години
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation преди 3 години
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import преди 5 години
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines преди 4 години
modifyDataset.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json преди 3 години
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines преди 4 години
organ_percentile.py f50a92ad9c Expanding analysis to additional segmentations in organ_percentile преди 2 години
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure преди 4 години
populateImagingFromTransferList.py f045cc682d Correcting a dangling if clause in populateImagingFromTransferList.py преди 2 години
preprocess.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. преди 3 години
runPython.sh 1cb816f9f9 Merge to core преди 3 години
runPythonnnUNet.sh f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output преди 3 години
runSegmentationDM.py c87c6e3cc1 Realinging runSegmentationDM to use nixWrapper to load dependencies преди 1 година
runSegmentationnnUNet.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. преди 3 години
test.py 43c785d716 Adding test.py script преди 3 години

README

Run with ./runPython.sh script.py