studen/irAEMM @ f045cc682dedf1e3c233f48019be6dfba636c97b

NIX User f045cc682d Correcting a dangling if clause in populateImagingFromTransferList.py		před 3 roky
..
README	53fb46eaa9 Updating to recent version	před 5 roky
addSegmentations.py	3dec2cb5da Update add segmentations	před 4 roky
anonymizeImages.py	ae65c9190e Updates	před 5 roky
anonymizeImagesNIfTI.py	53fb46eaa9 Updating to recent version	před 5 roky
anonymizeSegmentations.py	05fa966798 Recent updates	před 4 roky
copyAnonymizedDataset.py	1f7661b703 Adding database management routines	před 5 roky
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py	1f7661b703 Adding database management routines	před 5 roky
copyToOrthanc.py	1fd9314ca6 Initial import	před 5 roky
fillClinicalDataInternational.ipynb	90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation	před 4 roky
findCandidatesForSchedule.py	d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py	před 4 roky
generateFigures.py	04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc.	před 3 roky
getImages.py	1fd9314ca6 Initial import	před 5 roky
iraemmUploadTestPatients.ipynb	90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation	před 4 roky
makeAnonymizeLinks.py	1fd9314ca6 Initial import	před 5 roky
makeAnonymizedDataset.py	1f7661b703 Adding database management routines	před 5 roky
modifyDataset.py	e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json	před 4 roky
modifyPatients.py	1f7661b703 Adding database management routines	před 5 roky
organ_percentile.py	04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc.	před 3 roky
populateImagingFromOrthanc.py	07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure	před 4 roky
populateImagingFromTransferList.py	f045cc682d Correcting a dangling if clause in populateImagingFromTransferList.py	před 3 roky
preprocess.py	04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc.	před 3 roky
runPython.sh	1cb816f9f9 Merge to core	před 4 roky
runPythonnnUNet.sh	f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output	před 4 roky
runSegmentationDM.py	9ae439d111 Adding segmentation configuration files	před 4 roky
runSegmentationnnUNet.py	04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc.	před 3 roky
test.py	43c785d716 Adding test.py script	před 4 roky

		
				README
			
				Run with ./runPython.sh script.py