Andrej Studen @ VBOX 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines 8 달 전
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README.md 0ea84c60d5 Changing README to md format, allowing pre-configured path for model in testConfig 1 년 전
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations 3 년 전
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates 4 년 전
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version 4 년 전
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates 3 년 전
copyAnonymizedDataset.py 5c691d080a Adding copyAnonymizedDataset.py 1 년 전
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 년 전
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import 4 년 전
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 년 전
findCandidatesForSchedule.py d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py 3 년 전
generateFigures.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. 3 년 전
generateNPZ.ipynb 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines 8 달 전
generateNPZ.py 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines 8 달 전
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import 4 년 전
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 년 전
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import 4 년 전
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 년 전
modifyDataset.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json 3 년 전
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 년 전
organ_percentile.py f50a92ad9c Expanding analysis to additional segmentations in organ_percentile 1 년 전
parseNPZ.py 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines 8 달 전
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure 3 년 전
populateImagingFromTransferList.py f045cc682d Correcting a dangling if clause in populateImagingFromTransferList.py 2 년 전
preprocess.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. 3 년 전
runPython.sh 1cb816f9f9 Merge to core 3 년 전
runPythonnnUNet.sh f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output 3 년 전
runSegmentationDM.py 6ddf9fcc67 Adding entry filter to allow for selection in processing, also, debug parameter in template stops processing after the first entry 1 년 전
runSegmentationnnUNet.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. 3 년 전
test.py 43c785d716 Adding test.py script 3 년 전

README.md

Run with ./runPython.sh script.py