nixWorker 5d271b8076 Changing ofb to ofb.net for store and set routines преди 3 месеца
..
README.md 0ea84c60d5 Changing README to md format, allowing pre-configured path for model in testConfig преди 2 години
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations преди 5 години
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates преди 5 години
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version преди 6 години
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates преди 5 години
copyAnonymizedDataset.py 5c691d080a Adding copyAnonymizedDataset.py преди 3 години
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines преди 5 години
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import преди 6 години
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation преди 4 години
findCandidatesForSchedule.py d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py преди 4 години
generateFigures.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. преди 4 години
generateNPZ.ipynb 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines преди 2 години
generateNPZ.py 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines преди 2 години
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import преди 6 години
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation преди 4 години
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import преди 6 години
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines преди 5 години
modifyDataset.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json преди 4 години
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines преди 5 години
organ_percentile.py a0db02555b Speeding up organ_percentile by looking up a set of participants only преди 3 месеца
parseNPZ.py 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines преди 2 години
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure преди 5 години
populateImagingFromTransferList.py 5061002916 Adding parseDate to account for change of date format from newer versions of labkey преди 11 месеца
preprocess.py 5d271b8076 Changing ofb to ofb.net for store and set routines преди 3 месеца
runPython.sh 1cb816f9f9 Merge to core преди 4 години
runPythonnnUNet.sh f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output преди 4 години
runSegmentationDM.py 6ddf9fcc67 Adding entry filter to allow for selection in processing, also, debug parameter in template stops processing after the first entry преди 2 години
runSegmentationnnUNet.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. преди 4 години
test.py 793bc4375e Updated test script преди 3 месеца

README.md

Run with ./runPython.sh script.py