nixWorker 5d271b8076 Changing ofb to ofb.net for store and set routines před 3 měsíci
..
README.md 0ea84c60d5 Changing README to md format, allowing pre-configured path for model in testConfig před 2 roky
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations před 5 roky
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates před 5 roky
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version před 6 roky
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates před 5 roky
copyAnonymizedDataset.py 5c691d080a Adding copyAnonymizedDataset.py před 3 roky
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines před 5 roky
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import před 6 roky
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation před 4 roky
findCandidatesForSchedule.py d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py před 4 roky
generateFigures.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. před 4 roky
generateNPZ.ipynb 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines před 2 roky
generateNPZ.py 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines před 2 roky
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import před 6 roky
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation před 4 roky
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import před 6 roky
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines před 5 roky
modifyDataset.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json před 4 roky
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines před 5 roky
organ_percentile.py a0db02555b Speeding up organ_percentile by looking up a set of participants only před 3 měsíci
parseNPZ.py 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines před 2 roky
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure před 5 roky
populateImagingFromTransferList.py 5061002916 Adding parseDate to account for change of date format from newer versions of labkey před 11 měsíci
preprocess.py 5d271b8076 Changing ofb to ofb.net for store and set routines před 3 měsíci
runPython.sh 1cb816f9f9 Merge to core před 4 roky
runPythonnnUNet.sh f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output před 4 roky
runSegmentationDM.py 6ddf9fcc67 Adding entry filter to allow for selection in processing, also, debug parameter in template stops processing after the first entry před 2 roky
runSegmentationnnUNet.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. před 4 roky
test.py 793bc4375e Updated test script před 3 měsíci

README.md

Run with ./runPython.sh script.py