Andrej Studen @ VBOX 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines před 8 měsíci
..
README.md 0ea84c60d5 Changing README to md format, allowing pre-configured path for model in testConfig před 1 rokem
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations před 3 roky
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates před 4 roky
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version před 4 roky
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates před 3 roky
copyAnonymizedDataset.py 5c691d080a Adding copyAnonymizedDataset.py před 1 rokem
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines před 4 roky
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import před 4 roky
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation před 3 roky
findCandidatesForSchedule.py d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py před 3 roky
generateFigures.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. před 2 roky
generateNPZ.ipynb 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines před 8 měsíci
generateNPZ.py 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines před 8 měsíci
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import před 4 roky
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation před 3 roky
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import před 4 roky
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines před 4 roky
modifyDataset.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json před 3 roky
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines před 4 roky
organ_percentile.py f50a92ad9c Expanding analysis to additional segmentations in organ_percentile před 1 rokem
parseNPZ.py 7dad40c53c Removing minor errors in NPZ routines před 8 měsíci
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure před 3 roky
populateImagingFromTransferList.py f045cc682d Correcting a dangling if clause in populateImagingFromTransferList.py před 2 roky
preprocess.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. před 2 roky
runPython.sh 1cb816f9f9 Merge to core před 3 roky
runPythonnnUNet.sh f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output před 3 roky
runSegmentationDM.py 6ddf9fcc67 Adding entry filter to allow for selection in processing, also, debug parameter in template stops processing after the first entry před 1 rokem
runSegmentationnnUNet.py 04a1454e76 Robustifying for missing images, mismatches, etc. před 2 roky
test.py 43c785d716 Adding test.py script před 3 roky

README.md

Run with ./runPython.sh script.py