Domů Procházet Nápověda
Přihlásit se
studen
/
irAEMM
1
0
Rozštěpit 0
Soubory Úkoly 0 Pull Requesty 0 Wiki
Strom: e452adcbb8
Větve Značky
irAEMM
/
pythonScripts
Andrej Studen e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json před 3 roky
..
README 53fb46eaa9 Updating to recent version před 5 roky
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations před 4 roky
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates před 4 roky
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version před 5 roky
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates před 4 roky
copyAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines před 4 roky
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines před 4 roky
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import před 5 roky
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation před 3 roky
findCandidatesForSchedule.py d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py před 3 roky
generateFigures.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json před 3 roky
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import před 5 roky
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation před 3 roky
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import před 5 roky
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines před 4 roky
modifyDataset.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json před 3 roky
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines před 4 roky
organ_percentile.py c7f8174426 Adding organ_percentile calculation, runs with segmentation.json před 3 roky
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure před 4 roky
populateImagingFromTransferList.py 7df6a921f2 Updating populateImageFromTransferList to update failureStatus před 3 roky
preprocess.py 0cb3f65861 Adding comments and redirecting gzip to setup.json indicated binary in preprocess.py před 3 roky
runPython.sh 1cb816f9f9 Merge to core před 3 roky
runPythonnnUNet.sh f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output před 3 roky
runSegmentationDM.py 9ae439d111 Adding segmentation configuration files před 3 roky
runSegmentationnnUNet.py d18ee3ff86 Correcting spelling error před 3 roky
test.py 43c785d716 Adding test.py script před 3 roky

README

Run with ./runPython.sh script.py