Главная Обзор Помощь
Вход
studen
/
irAEMM
1
0
Ответвить 0
Файлы Задачи 0 Запросы на слияние 0 Вики
Дерево: e452adcbb8
Ветки Метки
irAEMM
/
pythonScripts
Andrej Studen e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json 3 лет назад
..
README 53fb46eaa9 Updating to recent version 4 лет назад
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations 4 лет назад
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates 4 лет назад
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version 4 лет назад
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates 3 лет назад
copyAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 лет назад
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 лет назад
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import 4 лет назад
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 лет назад
findCandidatesForSchedule.py d027e88d51 Adding findCandidatesForSchedule.py 3 лет назад
generateFigures.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json 3 лет назад
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import 4 лет назад
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 лет назад
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import 4 лет назад
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 лет назад
modifyDataset.py e452adcbb8 Adding recent scripts, particularly generateFigures.py and updates to segmentationIRAEMM_ONKO.json 3 лет назад
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 лет назад
organ_percentile.py c7f8174426 Adding organ_percentile calculation, runs with segmentation.json 3 лет назад
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure 4 лет назад
populateImagingFromTransferList.py 7df6a921f2 Updating populateImageFromTransferList to update failureStatus 3 лет назад
preprocess.py 0cb3f65861 Adding comments and redirecting gzip to setup.json indicated binary in preprocess.py 3 лет назад
runPython.sh 1cb816f9f9 Merge to core 3 лет назад
runPythonnnUNet.sh f1c4e7b732 Adding un-buffer flag to python for uptodate output 3 лет назад
runSegmentationDM.py 9ae439d111 Adding segmentation configuration files 3 лет назад
runSegmentationnnUNet.py d18ee3ff86 Correcting spelling error 3 лет назад
test.py 43c785d716 Adding test.py script 3 лет назад

README

Run with ./runPython.sh script.py