studen/irAEMM @ ab22d0e9bf57d93bf15e0478a8cdd098cd65698f

Andrej Studen ab22d0e9bf Splitting runPython.sh to runPythonnnUNet.sh to use with nnUNet code		před 3 roky
..
README	53fb46eaa9 Updating to recent version	před 4 roky
addSegmentations.py	3dec2cb5da Update add segmentations	před 4 roky
anonymizeImages.py	ae65c9190e Updates	před 4 roky
anonymizeImagesNIfTI.py	53fb46eaa9 Updating to recent version	před 4 roky
anonymizeSegmentations.py	05fa966798 Recent updates	před 3 roky
copyAnonymizedDataset.py	1f7661b703 Adding database management routines	před 4 roky
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py	1f7661b703 Adding database management routines	před 4 roky
copyToOrthanc.py	1fd9314ca6 Initial import	před 4 roky
fillClinicalDataInternational.ipynb	90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation	před 3 roky
getImages.py	1fd9314ca6 Initial import	před 4 roky
iraemmUploadTestPatients.ipynb	90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation	před 3 roky
makeAnonymizeLinks.py	1fd9314ca6 Initial import	před 4 roky
makeAnonymizedDataset.py	1f7661b703 Adding database management routines	před 4 roky
modifyPatients.py	1f7661b703 Adding database management routines	před 4 roky
populateImagingFromOrthanc.py	07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure	před 4 roky
populateImagingFromTransferList.py	05fa966798 Recent updates	před 3 roky
preprocess.py	d23fdfb3fd Updating preprocess.py	před 4 roky
runPython.sh	ab22d0e9bf Splitting runPython.sh to runPythonnnUNet.sh to use with nnUNet code	před 3 roky
runPythonnnUNet.sh	ab22d0e9bf Splitting runPython.sh to runPythonnnUNet.sh to use with nnUNet code	před 3 roky
runSegmentationDM.py	9ae439d111 Adding segmentation configuration files	před 3 roky
runSegmentationnnUNet.py	9ae439d111 Adding segmentation configuration files	před 3 roky
test.py	43c785d716 Adding test.py script	před 3 roky

		
				README
			
				Run with ./runPython.sh script.py