Andrej Studen ab22d0e9bf Splitting runPython.sh to runPythonnnUNet.sh to use with nnUNet code 3 jaren geleden
..
README 53fb46eaa9 Updating to recent version 4 jaren geleden
addSegmentations.py 3dec2cb5da Update add segmentations 4 jaren geleden
anonymizeImages.py ae65c9190e Updates 4 jaren geleden
anonymizeImagesNIfTI.py 53fb46eaa9 Updating to recent version 4 jaren geleden
anonymizeSegmentations.py 05fa966798 Recent updates 3 jaren geleden
copyAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 jaren geleden
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 jaren geleden
copyToOrthanc.py 1fd9314ca6 Initial import 4 jaren geleden
fillClinicalDataInternational.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 jaren geleden
getImages.py 1fd9314ca6 Initial import 4 jaren geleden
iraemmUploadTestPatients.ipynb 90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation 3 jaren geleden
makeAnonymizeLinks.py 1fd9314ca6 Initial import 4 jaren geleden
makeAnonymizedDataset.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 jaren geleden
modifyPatients.py 1f7661b703 Adding database management routines 4 jaren geleden
populateImagingFromOrthanc.py 07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure 4 jaren geleden
populateImagingFromTransferList.py 05fa966798 Recent updates 3 jaren geleden
preprocess.py d23fdfb3fd Updating preprocess.py 4 jaren geleden
runPython.sh ab22d0e9bf Splitting runPython.sh to runPythonnnUNet.sh to use with nnUNet code 3 jaren geleden
runPythonnnUNet.sh ab22d0e9bf Splitting runPython.sh to runPythonnnUNet.sh to use with nnUNet code 3 jaren geleden
runSegmentationDM.py 9ae439d111 Adding segmentation configuration files 3 jaren geleden
runSegmentationnnUNet.py 9ae439d111 Adding segmentation configuration files 3 jaren geleden
test.py 43c785d716 Adding test.py script 3 jaren geleden

README

Run with ./runPython.sh script.py