studen/irAEMM @ ab22d0e9bf57d93bf15e0478a8cdd098cd65698f

Andrej Studen ab22d0e9bf Splitting runPython.sh to runPythonnnUNet.sh to use with nnUNet code		3 роки тому
..
README	53fb46eaa9 Updating to recent version	4 роки тому
addSegmentations.py	3dec2cb5da Update add segmentations	4 роки тому
anonymizeImages.py	ae65c9190e Updates	4 роки тому
anonymizeImagesNIfTI.py	53fb46eaa9 Updating to recent version	4 роки тому
anonymizeSegmentations.py	05fa966798 Recent updates	3 роки тому
copyAnonymizedDataset.py	1f7661b703 Adding database management routines	4 роки тому
copyAnonymizedImagesToOrthanc.py	1f7661b703 Adding database management routines	4 роки тому
copyToOrthanc.py	1fd9314ca6 Initial import	4 роки тому
fillClinicalDataInternational.ipynb	90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation	3 роки тому
getImages.py	1fd9314ca6 Initial import	4 роки тому
iraemmUploadTestPatients.ipynb	90b4734ea6 Adding iypnb jupyter scripts for database manipulation	3 роки тому
makeAnonymizeLinks.py	1fd9314ca6 Initial import	4 роки тому
makeAnonymizedDataset.py	1f7661b703 Adding database management routines	4 роки тому
modifyPatients.py	1f7661b703 Adding database management routines	4 роки тому
populateImagingFromOrthanc.py	07478c6846 Making populateImagingFromOrthance.py use Analysis/Run infrastructure	4 роки тому
populateImagingFromTransferList.py	05fa966798 Recent updates	3 роки тому
preprocess.py	d23fdfb3fd Updating preprocess.py	4 роки тому
runPython.sh	ab22d0e9bf Splitting runPython.sh to runPythonnnUNet.sh to use with nnUNet code	3 роки тому
runPythonnnUNet.sh	ab22d0e9bf Splitting runPython.sh to runPythonnnUNet.sh to use with nnUNet code	3 роки тому
runSegmentationDM.py	9ae439d111 Adding segmentation configuration files	3 роки тому
runSegmentationnnUNet.py	9ae439d111 Adding segmentation configuration files	3 роки тому
test.py	43c785d716 Adding test.py script	3 роки тому

		
				README
			
				Run with ./runPython.sh script.py